WES и WGS чрез NGS при неврологични заболявания
Изследването за възможно неврогенетично заболяване започва с оценка на фенотипа на пациента. В зависимост от находките лекарят насочва пациента към подходящ генетичен анализ.
Секвенирането на целия екзом (WES, 100X) и секвенирането на целия геном (WGS, 30X) използват секвениране от ново поколение и могат да откриват малки делеции, дупликации и еднонуклеотидни варианти. Заболяванията, причинени от големи пренареждания, хромозомни аномалии или експанзии на повтори, изискват други молекулярни анализи.
NGS може да се използва за таргетирани мултигенни панели, всички кодиращи екзони (WES) или целия геном (WGS). WES изследва кодиращите области, в които се срещат много от вариантите, причиняващи заболявания, и може да идентифицира известни или нови варианти, вторични находки, носителство и фармакогенетични варианти.
Митохондриална ДНК
Митохондриалната ДНК съдържа 37 гена, кодиращи 13 протеина, 22 транспортни РНК и 2 рибозомни РНК. Митохондриите подпомагат производството на енергия и участват в регулацията на калция, апоптозата и метаболизма. Заболяванията на митохондриалната ДНК могат да засегнат очите, слуха, хормоните, сърцето, стомашно-чревния тракт, нервната система, мускулите, черния дроб и бъбреците.
В зависимост от фенотипа и фамилната анамнеза специалистът може да назначи анализ на целия митохондриален геном чрез NGS или таргетно секвениране по Sanger.
Избрани митохондриални синдроми
MELAS (MT-TL1, MT-ND3, MT-ND5, MT-CYTB); CPEO (MT-TV, MT-TL2); Kearns–Sayre (голяма делеция на митохондриалната ДНК); MIDD (MT-TL1, MT-ND1); MERRF (MT-TK, MT-ND5); LHON (MT-ND1, MT-CO3, MT-ND6, MT-ND4); синдром на Leigh и NARP (MT-ATP6, MT-ND6, MT-ND4); синдром на Pearson (голяма делеция на митохондриалната ДНК).